Skip to content

Przedoperacyjny test diagnostyczny odróżniający łagodny od złośliwego raka tarczycy na podstawie ekspresji genów czesc 4

2 miesiące ago

726 words

Ponadto, immunoreaktywność z obydwoma przeciwciałami w FTC była częściej rozproszona niż ogniskowa i była silniejsza w porównaniu z obserwowaną w czterech FTA. Barwienie za pomocą czynnika VIII von Willebranda zastosowano do rozróżnienia komórek śródbłonka we wszystkich tkankach. Umiarkowane barwienie przeciwciałem CA9 obserwowano w dwóch FTC (przypadki 11 i 12), ale nie w FTA i prawidłowych tkankach (dane nie pokazane). Analiza statystyczna. Najpierw zastosowaliśmy przewidywane przez SAGE różnice między globalną ekspresją genów FTA i FTC w celu identyfikacji 17 potencjalnych markerów molekularnych w tarczycy. Czternaście z 17 genów wykazało pewną różnicę za pomocą RT-PCR na niezależnym zestawie pacjentów i zastosowano je do analizy statystycznej. Ta analiza porównująca FTC i FTA ujawniła, że poziomy ekspresji czterech genów różniły się w tym zbiorze danych. Geny zostały zadeklarowane jako odmienne w obu grupach, jeśli wartość P była mniejsza niż rodzinna stopa błędu wynosząca 0,10. Test Wilcoxona wykazał, że różnica w ekspresji genów DDIT3, ARG2 i ITM1 była statystycznie istotna na poziomie 0,05. Ekspresja dodatkowego genu (C1orf24) była statystycznie istotna na poziomie 0,10. Test ucznia wykazał, że poziomy ekspresji DDIT3 i ITM1 były znaczące na poziomie 0,05. Żadne dodatkowe geny nie były znaczące na poziomie 0.10. Tak więc poziomy ekspresji czterech genów (DDIT3, ARG2, ITM1 i C1orf24) zostały zadeklarowane jako znacząco różne w obu grupach; Poziomy ekspresji DDIT3 i ITM1 zostały w obu analizach znacząco zróżnicowane. W predyktorze klasy użyto genów, których poziomy ekspresji zostały znacząco zadeklarowane na poziomie 0,10 przy użyciu testu t. Statystyka próbki t została wykorzystana jako waga w złożonym współczynniku zmiennych. Aby ocenić predykator, użyliśmy sprawdzania krzyżowego typu zostaw jeden jeden : dla każdej próbki z kolei pominięto jedną próbkę, a predykcję opracowano na pozostałych 22 próbkach. Została przewidziana pominięta próbka. Zastosowaliśmy wszystkie etapy procedury predykcji, w tym dobór genów o różnej ekspresji, a także stworzenie reguły predykcji (23, 24). Przy użyciu sprawdzania krzyżowego typu zostaw jeden , 19 z 23 próbek (83%) zostało poprawnie przewidzianych. Aby ocenić znaczenie tych wyników prognoz, wdrożyliśmy test permutacji (23, 24); odsetek losowych permutacji z czterema lub mniej błędnymi klasyfikacjami wynosił 0,007. W związku z tym ogłosiliśmy, że wyniki analizy predykcyjnej są znaczące. Dwa z genów, DDIT3 i ITM1, były zawsze wybierane na każdym etapie procedury sprawdzania krzyżowego (tj. Za każdym razem, gdy próbka została pominięta). Figura 2 pokazuje końcowe produkty dla trzech genów, których ekspresja różnicowa okazała się statystycznie znacząca na poziomie 0,05, po 40 cyklach PCR przeprowadzono przy użyciu szablonów z FTC, FTA, normalnej tarczycy i linii komórkowych. Zgodność między wynikami barwienia immunohistochemicznego na niezależnym zestawie guzów a diagnozą za pomocą histopatologii oszacowano na podstawie.. Szacowany. wynosiła 0,76 przy 95% przedziale ufności [0,59, 0,93]. Wartość 0,76 odpowiada znacznej sile porozumienia opartej na wcześniej opracowanych wytycznych (25). Kliniczne, patologiczne i molekularne korelacje. Wszyscy pacjenci otrzymali pooperacyjną ablację radiojodu i terapię tyroksyną supresyjną. Nawrót nowotworu obserwowano w trzech przypadkach FTC (Tabela 2). Wszyscy pacjenci przebadani za pomocą RT-PCR zostali również sprawdzeni pod względem przegrupowania PPARG-PAX8. Analiza wykazała, że przegrupowanie PPARG-PAX8, uprzednio zidentyfikowanego jako marker FTC (9), stwierdzono w około 33% FTA i w 33% FTC (C. Nakabashi i wsp., Niepublikowane obserwacje) i nie rozróżniali gruczolaka i raka (tabela 2). Następnie porównaliśmy informacje kliniczne i patologiczne z wynikami uzyskanymi z ilościowej analizy RT-PCR. Korzystając z procedury sprawdzania krzyżowego, dokładność przewidywania oszacowano na 83%. Cztery z nich zostały błędnie zaklasyfikowane (przypadki 6, 8, 13 i 21, tabela 2). Przypadek 6, który wykazywał ekspresję DDIT3, ARG2 i ITM1, został ponownie oceniony przez doświadczonego patologa i nie wykazał żadnych dowodów na inwazję kapsułki lub naczyń krwionośnych. Jednak odnotowano Hashimoto zapalenie tarczycy i pozytywne wybarwianie zarówno dla ERBB2, jak i P53. W przypadku 8 wystąpiło również zapalenie tarczycy Hashimoto. Dłuższa obserwacja dla obu przypadków ujawni, czy są one prawdziwymi umowami o wolnym handlu. Przypadek 13 był FTC, który został zdiagnozowany jako minimalnie inwazyjny. Przypadek 21 był jednak FTC, w którym obecna była inwazja zarówno krwi, jak i kapsułki. Dyskusja W tym badaniu poszukiwaliśmy markerów molekularnych, które mogłyby poprawić przedoperacyjną diagnozę guzów pęcherzykowych tarczycy
[patrz też: kalendarzyk miesiączkowy ob, nadpobudliwość psychoruchowa u dzieci, badania elektrofizjologiczne ]
[podobne: ciasta bezglutenowe przepisy, peeling kawitacyjny przeciwwskazania, leki na wątrobę bez recepty ]