Skip to content

Przedoperacyjny test diagnostyczny odróżniający łagodny od złośliwego raka tarczycy na podstawie ekspresji genów ad 9

2 miesiące ago

437 words

Wstępne porównanie poziomów ekspresji przeprowadzono za pomocą testów opartych na rangach (suma rang Wilcoxona) i testach opartych na średnich (Student. St). Dane poddano transformacji logarytmicznej przed zastosowaniem testu ucznia. Porównanie zostało oznaczone jako statystycznie istotne, jeśli stwierdzono, że statystyczna suma rang lub odpowiadająca jej statystyka t są znaczące, przy użyciu. poziom, który został skorygowany (za pomocą korekty Bonferroni), aby utrzymać wskaźnik błędu dla rodziny na poziomie 0.10. Następnie badaliśmy rozwój modelu opartego na ekspresji, który można wykorzystać do przewidywania klasy rozpoznania nowotworu (FTA lub FTC). Przestrzegaliśmy zasad opisanych przez Radmachera i in. (24), i użyliśmy związku zmiennego współzmiennego dla danych ekspresji genów (24, 54). Wydajność predykatora została przetestowana za pomocą sprawdzania krzyżowego typu leave-one-out dla wszystkich etapów procedury predykcji (tj. Selekcja genów ulegających zróżnicowanej ekspresji, jak również stworzenie reguły przewidywania) (23). Oceniliśmy istotność działania predyktora za pomocą testu opartego na permutacji zarysowanego przez Radmachera i in. (24), w którym etykiety klas są permutowane w sposób losowy i oblicza się odsetek zestawów danych, które mają potwierdzoną krzyżowo stopę błędów tak małą, jak poziom błędu obserwowany w zbiorze danych. Ponieważ obliczanie wszystkich możliwych permutacji było zaporowe, wykorzystaliśmy 2000 losowych permutacji do oszacowania osiągniętego poziomu istotności. Oceniliśmy zgodność wyników barwienia immunohistochemicznego i patologicznej identyfikacji klasy (FTC vs. FTA) za pomocą. statystyka i budowanie przedziału ufności 95% (24). Sposób użycia . koryguje porozumienia między dwiema metodami (immunohistochemią i patologią), których można by oczekiwać przypadkowo. Maksymalna wartość. Odpowiadająca idealnej zgodności wynosi 1,0. Wykorzystaliśmy wcześniej sugerowane wytyczne (25) do oceny istotności wielkości statystyki. Dodatkowe materiały Zobacz dodatkowe dane Podziękowania Dziękujemy za pomoc Tracy-Ann Read, Anita Lal, Kathy Boon, Rita G. Coimbra i Maria José Carregosa Pinheiro dos Santos. JM Cerutti jest stypendystą Coordenaç. O de Aperfeicoamento de Pessoal de Nível Superior Brasília (Brazylia) i Federalnego Uniwersytetu S. O Paulo. Ann S. Tamariz zredagowała rękopis. Projekt ten był również częściowo wspierany przez Amerykański Narodowy Instytut Raka (Cancer Genome Anatomy Project) (umowa NCI S98-146), Molecular Classification of Tumors Initiative (U01 CA88128) oraz Ludwig Trust. Przypisy Niestandardowe skróty: aspiracja cienkoigłowa (FNA); pęcherzyk gruczolakowy tarczycy (FTA); folikularny rak tarczycy (FTC); Gruczolak komórek Hürthle a (HCA); seryjna analiza ekspresji genów (SAGE); Src-homologia 3 (SH3); cykl progowy (Ct). Konflikt interesów: Autorzy zadeklarowali brak konfliktu interesów.
[hasła pokrewne: maseczka z siemienia lnianego na włosy, polskie towarzystwo ginekologiczne, nakładanie żelu na paznokcie ]
[hasła pokrewne: kalendarzyk miesiączkowy ob, przeciwwskazania do mikrodermabrazji, diukowie hazzardu cda ]